MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium intracellulare MOTT-64 chromosome

Total Repeats: 10243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016948	GC	3	6	1558	1563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016948	CG	3	6	1584	1589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016948	CA	3	6	1633	1638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016948	TCGT	2	8	1683	1690	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016948	CGA	2	6	1728	1733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016948	TCG	2	6	1746	1751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016948	TTC	2	6	1826	1831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016948	CGT	2	6	1880	1885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016948	GGA	2	6	1931	1936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016948	GTT	2	6	1943	1948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016948	GTC	3	9	1966	1974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016948	G	6	6	2019	2024	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016948	TGAAGG	2	12	2053	2064	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016948	CCCGGC	2	12	4452	4463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_016948	GAG	2	6	4512	4517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016948	GCG	3	9	4524	4532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016948	CG	5	10	4531	4540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016948	GCCG	2	8	4553	4560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016948	CG	3	6	4565	4570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016948	GTC	2	6	4573	4578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016948	GCC	2	6	5004	5009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_016948	TGA	2	6	5202	5207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016948	CCGC	2	8	5212	5219	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_016948	GACC	2	8	7313	7320	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016948	CGCGG	2	10	11152	11161	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_016948	GAG	2	6	11165	11170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016948	TGC	2	6	12158	12163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016948	GGC	2	6	12178	12183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016948	TCG	2	6	12197	12202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016948	TCC	2	6	12282	12287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_016948	ACG	2	6	12378	12383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016948	ACC	2	6	12426	12431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_016948	GCA	2	6	13149	13154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016948	CA	3	6	13179	13184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016948	CG	3	6	13215	13220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016948	GTCG	2	8	13229	13236	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016948	G	6	6	14920	14925	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016948	GCC	2	6	14956	14961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_016948	GC	3	6	14997	15002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016948	GGCC	2	8	15005	15012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016948	CGG	2	6	15045	15050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016948	TCG	2	6	15074	15079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016948	GC	3	6	15109	15114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016948	CCCG	2	8	15677	15684	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_016948	CG	3	6	15683	15688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016948	ACA	2	6	15973	15978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016948	C	6	6	15984	15989	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_016948	CGCC	2	8	15997	16004	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_016948	CGG	2	6	16016	16021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016948	CAA	2	6	16052	16057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016948	TGC	2	6	16113	16118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016948	CAC	2	6	16139	16144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_016948	GGT	2	6	16206	16211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016948	ATTC	2	8	16253	16260	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016948	GTCG	2	8	16262	16269	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016948	TGC	2	6	16270	16275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016948	CGC	2	6	17431	17436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_016948	GC	3	6	17447	17452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016948	AGG	2	6	24127	24132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016948	CGG	2	6	24145	24150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016948	CTC	2	6	25679	25684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_016948	CCGG	2	8	25689	25696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016948	CAT	2	6	25714	25719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016948	CGT	2	6	26224	26229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016948	GGT	2	6	26282	26287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016948	GCG	2	6	28113	28118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016948	AGGGC	2	10	28119	28128	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_016948	GCG	2	6	28152	28157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016948	GTT	2	6	28196	28201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016948	TAC	2	6	28300	28305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016948	A	6	6	28369	28374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016948	CGG	2	6	28832	28837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016948	GCCG	2	8	29233	29240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016948	GT	3	6	29260	29265	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016948	GGC	2	6	29715	29720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016948	CAT	2	6	29774	29779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016948	CG	3	6	29824	29829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016948	TCG	2	6	29860	29865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016948	GGC	2	6	29898	29903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016948	CCT	2	6	29996	30001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_016948	AGCT	2	8	32628	32635	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016948	AGGG	2	8	32637	32644	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016948	GC	3	6	32652	32657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016948	TGC	2	6	32685	32690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016948	GCG	2	6	32691	32696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016948	TTA	2	6	34731	34736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016948	CGC	2	6	34741	34746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_016948	CGA	2	6	34771	34776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016948	GGT	2	6	34814	34819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016948	GCG	2	6	34836	34841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016948	GAG	2	6	34886	34891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016948	TCGG	2	8	34903	34910	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016948	CGCA	2	8	34915	34922	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_016948	A	6	6	34964	34969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016948	CGT	2	6	35018	35023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016948	TCC	2	6	36389	36394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_016948	GC	3	6	37829	37834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_016948	CAA	2	6	37888	37893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016948	AAC	2	6	38408	38413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016948	ACG	2	6	40118	40123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016948	TGC	2	6	40521	40526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016948	CGCC	2	8	40548	40555	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_016948	ACT	2	6	40556	40561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016948	CGG	2	6	42113	42118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016948	CGA	2	6	44807	44812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016948	CG	3	6	45160	45165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016948	C	7	7	45181	45187	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
108	NC_016948	GTC	2	6	45203	45208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016948	TC	3	6	45207	45212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016948	CTG	2	6	45228	45233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016948	CGG	2	6	45271	45276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016948	CG	3	6	45391	45396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016948	GCCG	2	8	46186	46193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016948	CGT	2	6	46212	46217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016948	CAA	2	6	47577	47582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016948	CGA	2	6	47624	47629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016948	GAT	2	6	47642	47647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016948	CCG	2	6	48679	48684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_016948	GC	3	6	49971	49976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016948	CAG	2	6	53675	53680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016948	ACG	2	6	54987	54992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016948	CGG	3	9	56837	56845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016948	CG	4	8	57673	57680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016948	CGG	2	6	57715	57720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016948	ACG	2	6	59742	59747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016948	GTC	2	6	60798	60803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016948	CGT	2	6	60816	60821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016948	CGC	2	6	60840	60845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_016948	TCGGC	2	10	60874	60883	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_016948	CGT	2	6	60897	60902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016948	CGT	2	6	60911	60916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016948	CGGC	2	8	60932	60939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_016948	GTC	2	6	60972	60977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016948	CAG	2	6	60996	61001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016948	CAC	2	6	61056	61061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_016948	GCA	2	6	61133	61138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016948	GAC	2	6	61153	61158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016948	CGA	2	6	61202	61207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016948	TCG	2	6	61273	61278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_016948	GCC	2	6	61295	61300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_016948	GGTC	2	8	61325	61332	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016948	GA	3	6	66588	66593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016948	CCG	2	6	66698	66703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_016948	GTT	2	6	66735	66740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016948	GCC	2	6	66742	66747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_016948	CGC	2	6	66760	66765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_016948	AAC	2	6	66766	66771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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153	NC_016948	GCC	2	6	69594	69599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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156	NC_016948	CG	3	6	74983	74988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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172	NC_016948	CGT	2	6	79973	79978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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193	NC_016948	CGCC	2	8	86843	86850	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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278	NC_016948	GCCCG	2	10	122707	122716	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
279	NC_016948	ATG	2	6	122784	122789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_016948	GGAT	2	8	122851	122858	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
281	NC_016948	TCG	2	6	122916	122921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_016948	CG	3	6	125406	125411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
283	NC_016948	ATG	2	6	125422	125427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_016948	TGGA	2	8	126435	126442	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_016948	GCC	2	6	132082	132087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_016948	CTCG	2	8	132097	132104	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
288	NC_016948	CCG	2	6	132660	132665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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290	NC_016948	CCT	2	6	134103	134108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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292	NC_016948	CCG	2	6	134143	134148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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424	NC_016948	GTG	2	6	187536	187541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
425	NC_016948	CGC	2	6	187577	187582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
426	NC_016948	CCG	2	6	187583	187588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
427	NC_016948	GCCCC	2	10	187612	187621	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
428	NC_016948	GCC	2	6	187671	187676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
429	NC_016948	GCGCC	2	10	187706	187715	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
430	NC_016948	CGC	2	6	187751	187756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
431	NC_016948	ACGT	2	8	190548	190555	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
432	NC_016948	CGG	2	6	190559	190564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_016948	CGC	2	6	190567	190572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
434	NC_016948	GCG	2	6	191440	191445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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439	NC_016948	AGT	2	6	195172	195177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_016948	CCG	2	6	197222	197227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
442	NC_016948	CGC	2	6	198330	198335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
443	NC_016948	ACA	2	6	198356	198361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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447	NC_016948	CGGC	2	8	202682	202689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
448	NC_016948	TGA	2	6	202764	202769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_016948	GT	3	6	207613	207618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
451	NC_016948	GAC	2	6	207637	207642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_016948	GAT	2	6	207690	207695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
453	NC_016948	TGG	2	6	207710	207715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
454	NC_016948	GCGTCG	2	12	208743	208754	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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456	NC_016948	CCG	2	6	208804	208809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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458	NC_016948	CA	4	8	208828	208835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
459	NC_016948	GTG	2	6	208869	208874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
460	NC_016948	GCC	2	6	208936	208941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
461	NC_016948	CGG	2	6	208955	208960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_016948	CGGC	2	8	208972	208979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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467	NC_016948	AGCGA	2	10	210300	210309	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
468	NC_016948	GAG	3	9	210311	210319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
469	NC_016948	CTG	2	6	212221	212226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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471	NC_016948	AGA	2	6	215637	215642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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